Transportado a una tierra de mitos y leyendas, el Príncipe de Persia se ve envuelto en una lucha épica entre las fuerzas básicas de la luz y la oscuridad. Involuntariamente, se convierte en testigo de la destrucción del legendario Árbol de la Vida, un hecho que amenaza con hundir al mundo entero en la oscuridad eterna. Junto a Elika, un nuevo acompañante del Príncipe, formarán un dúo acrobático y letal para acabar con la oscuridad.